個人獨資工廠在注銷稅務登記證和營業執照后，其稅務責任問題一直備受關注。根據中國相關法律法規，個人獨資企業屬于非法人企業，其所有者通常對企業的債務和稅務問題承擔無限責任。因此，即使工廠已完成注銷手續，如果后續發現存在未結清的稅務問題，原企業所有者仍可能需承擔相關責任。

具體來說，稅務機關在發現注銷前存在偷稅、漏稅或未足額繳納稅款的情況下，有權追溯并要求補繳稅款及滯納金。例如，如果注銷時隱瞞了真實收入或虛報費用，導致少繳稅款，稅務機關可依法追繳。滯納金會根據欠稅天數和金額計算，每日加收萬分之五。

如果涉及稅務違法行為，如虛開發票或逃避稅務監管，還可能面臨罰款甚至刑事責任。因此，在注銷前，建議聘請專業稅務咨詢服務機構進行審計和清理，確保所有稅務事項已妥善處理。

個人獨資工廠注銷后，稅務責任并不會自動免除，所有者應保持警惕，及時咨詢專業機構以避免潛在風險。